В документации есть примеры использования одной Click to Call кнопки. Как можно использовать много кнопок одновременно?

Прочитайте пожалуйста документацию Click to Call:
http://docs.flashphoner.com/display/WCS/Click2call
http://docs.flashphoner.com/display/WCS/Click2call+quick+start
http://docs.flashphoner.com/display/WCS/Autologin

В документации приведены статические примеры конфигов account.xml и callee.xml, которые расположены в директории at /usr/local/FlashphonerWebCallServer/conf
Эти конфиги могут быть динамическими. Для этого вы можете использовать динамические PHP скрипты, которые отдают каждый раз новые конфиги по запросу WCS3.

Примеры:
http://mydomain.com/account.php?token=12345
http://mydomain.com/callee.php?token=12345

Таким образом, вы можете использовать множество Click to Call коннектов одновременно и параллельно звонить на множество направлений. Управлять этими коннектами и направлениями вы можете через
динамические PHP скрипты, которые возвращают XML в формате account.xml и callee.xml как описано в документации.