Как сделать так чтобы клиентское приложение автоматически логинилось и звонило на указанный номер?

Это функции Autologin и Click2Call. Пожалуйста прочитайте соответствующую документацию. Там подобно описаны необходимые настройки.

Autologin по токену: http://docs.flashphoner.com/display/WCS/Autologin
Click to Call по токену: http://docs.flashphoner.com/display/WCS/Click2call+quick+start
http://docs.flashphoner.com/display/WCS/Click2call+quick+start

Вы можете так же использовать динамические скрипты, например PHP, которые будут автоматически раздавать логины и направления.